Фамилия Сизиумова — редкая и необычная по звучанию, что сразу наводит на мысль об искусственном или книжном происхождении. Скорее всего, её основа — латинское слово sizyum (сизиум), за которым в ботанике стоит род тропических деревьев семейства миртовых, куда входят, например, гвоздичное дерево и яванская слива. Фамилия могла появиться в среде духовенства: в семинариях выпускникам нередко давали «говорящие» фамилии по названиям растений, цветов или библейских реалий, особенно если их исходная фамилия казалась неблагозвучной. В таком случае Сизиумова — это «ботаническая» фамилия, образованная по той же модели, что и Фиалков, Розов, Лилов.

Суффикс -ов- указывает на стандартную русскую патронимическую модель, но здесь он присоединён не к имени или прозвищу, а к латинизированному научному термину. Женская форма Сизиумова говорит о том, что носительница — женщина, а её предок по мужской линии носил фамилию Сизиумов. Встречается такая фамилия крайне редко, в основном в центральных регионах России, и, вероятно, принадлежала потомкам выпускников духовных училищ или семинарий XIX века, где любили давать «цветочные» и «растительные» фамилии.

Менее вероятная, но возможная версия — происхождение от прозвища Сизиум, которое могло быть связано с диалектным словом «сизый» (серо-голубой) через искажённую форму, но это спорно: слишком далеко от живого языка до латинского окончания. Учитывая редкость фамилии, можно с высокой долей уверенности утверждать, что её носители — потомки либо священнослужителей, либо людей, получивших фамилию в учебном заведении.