Фамилия Сизков образована от прозвища Сизок — так в русских говорах называли человека с сизым, то есть серо-голубым оттенком кожи, волос или глаз. Слово «сизый» в народной речи имело широкий спектр значений: от цвета оперения голубя до болезненной бледности или синевы после холода. Прозвище могли дать либо за необычную внешность (седой с синевой, светлоглазый), либо за привычку зябнуть, мерзнуть — «сизеть» на ветру.

Модель фамилии проста: основа Сиз(ок) плюс суффикс -ов, который в русских фамилиях указывает на принадлежность: «сын Сизка». В разговорной речи прозвище Сизок быстро превратилось в Сизко (с беглой гласной), а от него уже пошли Сизковы. Суффикс -ок в основе — уменьшительно-ласкательный или пренебрежительный, что типично для прозвищ внешности: Сизок — это не просто «сизый», а «сизый, но мелкий, молодой или несерьёзный».

Фамилия встречается в основном на севере и северо-востоке европейской России — в Вологодской, Кировской, Архангельской областях. Там слово «сизый» было особенно употребительно для описания цвета глаз (серо-голубые, «сизые»), а также для масти лошадей или оперения птиц. В этих краях фамилия могла возникнуть и от названия птицы сизокрылки, но скорее всего корень остаётся антропонимическим.

Редкая черта фамилии Сизков — она почти не имеет параллелей с суффиксом -ин (Сизкин, Сизов). Это говорит о том, что прозвище Сизок было мужским и не перешло в форму притяжательного прилагательного от женского имени. Кроме того, фамилия не связана с географическими названиями — нет сёл или рек Сизково, которые могли бы дать прозвище переселенцам. Всё указывает на чисто прозвищное происхождение от личной черты первого носителя.