Фамилия Сизунова — это женская форма, мужской вариант которой Сизунов. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Сизун. В русской ономастике суффикс «-ун» указывает на деятеля или носителя яркого признака. Сизуном могли назвать человека с сизым, то есть тёмно-серым с синеватым отливом, цветом лица, волос или, что вероятнее, — с сизыми глазами. В говорах «сизый» часто означало не просто цвет, а тусклый, блёклый оттенок, поэтому прозвище могло относиться к внешности или даже к характеру: «сизый» как сизый голубь — вялый, задумчивый.

Суффикс «-ун» в русских фамилиях встречается реже, чем «-ов» или «-ин», и обычно образует названия по характерному действию или свойству: говорун, молчун, ворчун. Сизун — более редкий вариант, он закрепился именно как прозвище, а не как производное от профессии. Фамилия образована по стандартной патронимической модели: сын Сизуна стал Сизуновым, а его потомки — Сизуновы.

Географически фамилия Сизунова встречается в центральных и южных регионах России, особенно в бывших казачьих областях — на Дону, Кубани, в Ставрополье. Там прозвища по внешним признакам давали часто и охотно, и они легко переходили в фамилии. Интересно, что в некоторых документах XVII–XVIII веков фиксируется форма «Сизунов» без суффикса «-ов», то есть как прямое прозвище: «Сизун Иванов сын» — что подтверждает древность основы.

Версия о происхождении от птицы «сизый» (сизый голубь) или от слова «сизеть» (становиться сизым) менее убедительна: в русских фамилиях названия птиц обычно оформляются суффиксом «-ев» (Голубев, Соколов), а не «-унов». Так что Сизунов — это скорее прозвище человека, чем «сын сизого голубя».