Фамилия Скальницкая — женская форма фамилии Скальницкий, и её происхождение напрямую связано с польской или западнорусской (белорусской, украинской) ономастической традицией. Ключевой элемент здесь — суффикс -ский/-цкий, который в восточнославянских фамилиях чаще всего указывает на дворянское или шляхетское происхождение, либо на связь с географическим названием. В польской традиции фамилии на -ski были типичны для шляхты, а в русском языке они со временем распространились шире, но сохранили книжный оттенок.

Основа фамилии — Скальн- — скорее всего, восходит к польскому слову skała («скала») или skalny («скальный»). На это же указывает и украинский корень скальний (каменистый). Таким образом, Скальницкий — это человек, связанный с местом, где есть скалы, каменистая почва, или житель населённого пункта с похожим названием. В Польше и Западной Украине существуют топонимы Скала, Скальник, Скальне, от которых и могли образовать фамилию.

Версия о происхождении от прозвища «Скала» — то есть человека твёрдого, непоколебимого, как камень — менее вероятна. Фамилии на -ский крайне редко образуются напрямую от прозвищ, почти всегда — от названий мест. Поэтому основная гипотеза: предок носительницы фамилии владел землёй или жил в имении (деревне, местечке) с названием Скала, Скальники или Скальница. Типичная модель: владелец поместья Скальники становился Скальницким, а его дети и жена — Скальницкими.

В польских и белорусских метриках XVII–XVIII веков фамилия Скальницкий встречается среди мелкой шляхты, которая часто брала фамилию по названию своего фольварка (хутора). Если говорить о географии, то наибольшая концентрация носителей исторически фиксируется на территории современных Подляского и Мазовецкого воеводств Польши, а также в Гродненской области Беларуси. В России фамилия редкая и, как правило, указывает на польские или западнорусские корни семьи.

Форма Скальницкая (с окончанием -ая) — это русская адаптация польско-белорусского женского варианта Skalnicka. В польском языке прилагательные женского рода оканчиваются на -a, а в русском — на -ая, поэтому при переезде в Россию фамилия приобрела привычное для русского уха окончание.