Фамилия Скегины — редкий и самобытный памятник славянской культуры, и, как и положено таким памятникам, она хранит память о происхождении рода. Вопреки распространённому мнению, эта фамилия не имеет отношения к скандинавским или финским корням, хотя её звучание и кажется необычным для русского уха. Основа фамилии — прозвище Скега, которое в старых северорусских говорах означало «скряга» или «прижимистый человек». Слово бытовало в новгородских и олонецких землях, что сразу указывает на вероятный ареал возникновения фамилии — Русский Север.

Модель образования проста и типична для славянской ономастики: к основе на -а добавляется притяжательный суффикс -ин. Такой же путь прошли фамилии, образованные от личных имён и прозвищ, оканчивающихся на гласный или мягкий согласный: Пушкин (от Пушка), Ильин (от Илья), Скегин (от Скега). Подобные именования широко представлены у восточных, западных и южных славян, что делает фамилию частью общего славянского ономастического пласта, хотя и с яркой региональной окраской.

Прозвище Скега, лёгшее в основу фамилии, не стоит воспринимать как обидное. В крестьянской среде хозяйственность и бережливость ценились высоко, а прозвища часто отражали не столько недостаток, сколько характерную черту, выделявшую человека. Предок Скегиных, вероятно, был рачительным хозяином, умевшим сберечь добро, — качество, без которого на севере, в условиях сурового климата, выжить было трудно. Так прозвище, данное с уважением или лёгкой иронией, закрепилось за родом.

Безусловно, процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности, поэтому окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Скегины можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований. Однако тот факт, что слово «скега» фиксируется именно в северных говорах, а фамилия встречается преимущественно в документах по Архангельской и Вологодской губерниям, делает версию о новгородском или поморском происхождении наиболее правдоподобной. Передаваясь из поколения в поколение, фамилия по сей день сохраняет эту связь с северной землёй, где когда-то жил человек, чью бережливость запомнили соседи.