Фамилия Скопоушченко — редкий случай, когда с первого взгляда ясно почти всё, кроме самого главного. Суффикс -енко уверенно указывает на украинское происхождение: в XVII–XVIII веках так образовывали фамилии на востоке и в центре Украины, особенно в казацкой среде. Основа фамилии — прозвище Скопоуска или Скопоух. Проблема в том, что ни в одном из доступных словарей украинских прозвищ, ни в ономастических справочниках Веселовского или Унбегауна такое слово не зафиксировано. Придётся разбирать его по частям.

Первая часть, «скоп», в украинских говорах может означать «скопление», «толпа» или «сбор». Но чаще в основе прозвищ лежит глагол «скопити» — оскопить, кастрировать. Это грубое, но нередкое прозвище для скотника или конюха, занимавшегося холощением животных. Вторая часть, «ух» или «ухо», могла быть либо усилительной приставкой (как в слове «скопоух» — буквально «тот, у кого ухо отрезано»), либо самостоятельным прозвищем по физическому недостатку. Наиболее правдоподобная версия: Скопоух — прозвище человека, который либо кастрировал скот (скопец-животновод), либо сам имел увечье уха, а потом к этому прозвищу добавили типичный украинский фамильный суффикс -енко, означающий «сын» или «потомок». То есть Скопоушченко — «сын Скопоуха».

Написание через «щ» (Скопоушченко вместо ожидаемого Скопоущенко) — результат украинской фонетики: звук «шч» передаёт мягкое «щ», которое в русском языке часто упрощается. Такая орфография — дополнительный маркер, что фамилия записана именно в украинской традиции, возможно, в документах XIX века.

Географически фамилия привязана к южным и центральным областям Украины — Черкасской, Киевской, Полтавской. Встречается она редко, и это не случайно: прозвище Скопоух было нелестным или узкопрофессиональным, поэтому его носители либо меняли фамилию при переезде, либо род был немногочисленным. Сословно предки, скорее всего, относились к казакам или крестьянам — никаких следов шляхетства или дворянства эта модель не несёт.