Фамилия Скульбоденко — редкий случай, когда географический и языковой анализ сразу указывает на единственный регион происхождения. Это украинская фамилия, образованная по продуктивной модели с суффиксом -енко, который на востоке и в центре Украины означал «сын» или «потомок». Основа фамилии — прозвище Скульбода.

В слове «Скульбода» легко угадываются два корня: «скуль» и «бода». Первый, скорее всего, восходит к диалектному глаголу «скулити» (скулить, жаловаться) или к «скульгавити» (захромать). Второй корень — «бода» — связан с «бодати» (бодать, толкать рогами). В сумме прозвище могло означать человека, который хромает и при этом бодается, то есть капризного, недовольного хромого. Но возможна и более бытовая версия: «скуль» — это искажённое «скула» (скула, щека), а «бода» — удар рогом. Тогда Скульбода — человек с выступающими скулами, которого легко задеть. В украинских говорах слово «скула» могло означать и «жалобщик», так что прозвище могло закрепиться за ворчуном.

Антропонимический словарь не фиксирует фамилию Скульбоденко в дворянских родословных книгах. Это типичная казацкая или крестьянская фамилия, распространённая в Черниговской, Полтавской или Киевской губерниях — там, где суффикс -енко был основным способом фамилиеобразования. В ревизских сказках XIX века носители такой фамилии, скорее всего, числились государственными крестьянами или казаками, а не помещичьими крепостными.

Интересная деталь: фамилия Скульбоденко — одна из немногих, где основа явно составная, но при этом не заимствована из польского или немецкого, как многие украинские фамилии на -енко. Она чисто восточнославянская, с прозрачной внутренней формой. Если ваш предок носил такую фамилию, он, вероятно, происходил из Левобережной Украины, и прозвище дали ему за характер или внешность, а не за профессию.