Фамилия Скуйбедин — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, разобрать почти невозможно без обращения к диалектам и старым промыслам. Скорее всего, перед нами прозвище, связанное с обработкой металла или дерева, а точнее — с действием «скуй беду». В северных и сибирских говорах «сковать беду» означало «накликать, навлечь несчастье», но вряд ли предка так называли за склонность к катастрофам. Вероятнее, что прозвище было ироничным, «охранительным» — давалось ребёнку, чтобы злые силы думали: «этот уже беду сковал, ничего ему не сделается». Подобная практика (называть дитя с отрицательным смыслом) хорошо известна у русских, украинцев и белорусов.

Менее правдоподобная, но возможная версия — профессиональная. В кузнечном деле «скуй» могло быть кратким повелительным наклонением: «скуй беду» — то есть «выкуй (изготовь) то, что отводит беду», например оберег или подкову. Однако для фамилий такая конструкция с глаголом в повелительном наклонении и существительным в винительном падеже нетипична. Чаще встречаются сочетания вроде «Скуйбеда» (сравните с фамилией Найденов — от «найден»). Суффикс -ин указывает на принадлежность: Скуйбедин — «сын Скуйбеды».

Фамилия почти не встречается за пределами России и не имеет очевидных аналогов в других славянских языках. В метрических книгах XIX века единичные записи Скуйбединых зафиксированы в Вятской и Пермской губерниях — регионах, где было развито кузнечное ремесло и сохранялись архаичные говоры. Если ваш предок носил эту фамилию, он, скорее всего, происходил из среды крестьян-ремесленников или старообрядцев, которые дольше других держались за охранительные прозвища.

С точки зрения словообразования, фамилия уникальна: глагольная основа с объектом в составе фамилий — редкость. Близкие по модели — Убейкобыла, Убейволк, но там ударение на первый слог, а в Скуйбедине — на второй. Это ещё раз подтверждает, что перед нами не случайное стяжение, а осмысленное прозвище, которое носил конкретный человек.