Фамилия Союачкина — редкий случай, где сразу бросается в глаза необычное сочетание гласных в корне. Наиболее вероятная версия происхождения связана с диалектным словом «союачка» — так в некоторых северных и сибирских говорах называли сойку, лесную птицу с ярким оперением. Если это так, то фамилия образована по типичной для русских фамилий модели: прозвище Союачка (человек, похожий на сойку повадками, голосом или внешностью) плюс суффикс -ин, указывающий на принадлежность: «чей?» — Союачкин, то есть сын или потомок Союачки. Женская форма Союачкина закрепилась за носительницей.

Суффикс -ин здесь не случаен. В русской ономастике он традиционно присоединялся к основам, оканчивающимся на -а/-я, и указывал на более тесную, почти семейную связь, чем -ов/-ев. Фамилии на -ин чаще встречались на севере и северо-востоке России, и если версия с сойкой верна, то географически фамилия могла зародиться именно там — в Архангельской, Вологодской или Вятской губерниях.

Есть и альтернативная, менее правдоподобная гипотеза: основа могла быть искажённым вариантом имени или прозвища, например, от тюркского «сой» (род, племя) или от календарного имени Софья (через народную форму Союшка). Но против этого говорит редкость и нехарактерность такого перехода: от Софьи ждали бы фамилию Софьин или Союшкин, а не Союачкин. Слово «союачка» как название птицы фиксируется в диалектных словарях, и это делает орнитологическую версию основной.

Написание фамилии с двумя гласными «юа» в корне — её визитная карточка. В дореволюционных метриках и переписях такая форма могла закрепиться из-за особенностей местного произношения: в говорах звук [й] между гласными часто выпадал, и «сойка» превращалось в «союка», а затем в «союачка». Таким образом, фамилия Союачкина — это не опечатка и не случайность, а живое свидетельство диалектной фонетики, сохранившееся в фамильном имени.