Фамилия Спитковская принадлежит к распространённому у славян типу фамилий, образованных от географических названий с помощью суффикса -ск-. В женском роде она выглядит как Спитковская, а мужской вариант — Спитковский. Такие фамилии обычно указывали на место, откуда родом человек: владение, село или город. Основа здесь — топоним Спитково или Спитков. На картах встречаются села с названием Спитков — например, в Волынской области Украины, а также в Польше (Spytków). Выходец из такого места получал прозвище «Спитковский», которое со временем закрепилось как фамилия.

Корень фамилии, скорее всего, восходит к прозвищу или имени Спитко. В западнославянских языках, особенно в польском, «spytać» означает «спросить», «разузнать». Спитком могли прозвать любопытного человека, который постоянно задавал вопросы, или, наоборот, того, к кому часто обращались за советом. Не исключена и связь с древнепольским именем Спитко (Spytko), которое было популярно в средневековой Польше — его носили, например, краковские воеводы. В этом случае фамилия ведет начало от имени предка.

Суффикс -ск- в фамилии — мощный маркер дворянского или шляхетского происхождения в Речи Посполитой. Спитковские, вероятно, принадлежали к польской или украинской шляхте, владевшей землей в селе Спитков. После разделов Польши и переходов территорий в состав Российской империи фамилия распространилась среди православного и католического населения. Встречается она и в еврейских семьях — как вариант ашкеназской фамилии, образованной от названия местечка (например, Спитков могло быть еврейским местечком на Волыни).

Однокоренные фамилии — Спитко, Спитков, Спитковский, Спиткевич. Редкий вариант Спитковская отличает ударение: оно может падать как на второй слог (СпиткОвская), так и на третий (СпиткОвская). Второй вариант ближе к польской произносительной норме, где ударение часто фиксировано на предпоследнем слоге.