Фамилия Стаюнин — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от распространённых фамилий на -ов/-ев, образованных от крестильных имён, здесь мы видим суффикс -ин, который обычно указывает на принадлежность: «чей?» — Стаюнин, то есть сын или потомок Стаюна. Основа — Стаюн — это и есть ключ к разгадке.

Скорее всего, Стаюн — это нецерковное прозвище или вариант имени. В русских говорах слово «стаять» могло означать «сойти, исчезнуть, растаять», но вряд ли прозвище давали по такому абстрактному действию. Куда правдоподобнее версия, что в основе лежит диалектное «стаюн» — так в некоторых регионах называли упрямого, настойчивого человека, который «стоит на своём» (от глагола «стоять»). Человек с таким прозвищем мог прослыть стойким, непоколебимым или даже упёртым.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с топонимом. В России есть несколько небольших речек и урочищ с названием Стая, но фамилии от них обычно давали с суффиксом -ский. Кроме того, нельзя полностью исключать искажение при переписи: фамилия могла возникнуть из прозвища Стаюн, которое, в свою очередь, является вариантом имени Станислав (через сокращение Стан → Стаюн). Однако это лишь гипотеза, не подтверждённая прямыми источниками.

Фамилия Стаюнин — яркий пример того, как прозвище, данное за характер или поведение, перешло в наследственное именование. Носители этой фамилии, скорее всего, происходят из крестьянской или мещанской среды центральной России, где бытовали такие говоры. Сегодня фамилия встречается редко, что делает её особенно ценной для тех, кто пытается восстановить историю своего рода по крупицам.