Фамилия Стипаненко звучит как украинская, и это первое, что приходит в голову. Суффикс -енко — один из самых распространённых в украинской ономастике, он означает «маленький», «сын» или «потомок». По этой модели образованы тысячи фамилий: от имени отца или его прозвища. В данном случае основа — Стипан. Это народная, диалектная форма крестильного имени Степан (от греческого стефанос — «венок», «венец»). В украинском языке имя Степан произносится твёрдо, с ударением на первом слоге, и на письме нередко отражается как «Стипан». Таким образом, Стипаненко — это «сын Стипана», то есть потомок человека по имени Степан.

Здесь есть одна особенность, которая отличает эту фамилию от более частого варианта «Степаненко». Написание через и в корне — не ошибка, а живой след местного говора. В некоторых регионах Украины, особенно на западе или в центральных областях, звук [е] в безударной позиции мог переходить в [и]. Это явление называется «иканьем» и характерно, например, для полесских и подольских говоров. Поэтому фамилия Стипаненко — не просто вариант, а указание на конкретную диалектную среду, где фамилию записали со слуха, так, как произносили сами носители.

С точки зрения социальной истории, Стипаненко — фамилия крестьянская или казацкая. Она не указывает на дворянское происхождение, а фиксирует родовую связь с конкретным предком. В реестрах запорожских казаков и в метрических книгах XVIII–XIX веков такие фамилии на -енко встречаются сплошь и рядом. Носитель фамилии Стипаненко мог быть хлеборобом, ремесленником или казаком, но точнее сказать трудно — фамилия говорит только о том, что его предка звали Степаном.

По географии фамилия редкая. В отличие от «Степаненко», которая встречается по всей Украине и на юге России, вариант с «и» локализован сильнее. Встречается он преимущественно в Черниговской, Сумской, Полтавской областях, а также среди потомков переселенцев на Кубани. В современной России фамилия Стипаненко тоже есть, но это, скорее всего, след миграций конца XIX — начала XX века.

Если сравнивать её с однокоренными, то «Степаненко» — литературная норма, а «Стипаненко» — её диалектная сестра. Есть ещё фамилия «Степанюк» (с суффиксом -юк, типичным для Волыни и Полесья) и «Степанов» (русская модель на -ов). Но Стипаненко стоит особняком именно из-за фонетики: она сохранила живое народное произношение, которое в официальных документах закрепили как отдельную фамилию.