Фамилия Стопачинская — женская форма фамилии Стопачинский, и её разговор стоит начать с географии. Эта фамилия почти наверняка имеет польское или западноукраинское происхождение. Характерный суффикс «-ский/-цкий» в славянских фамилиях указывает либо на принадлежность к месту (топонимическая фамилия), либо на дворянское сословие (в Польше и Речи Посполитой такие фамилии носили в основном шляхтичи). В данном случае основа «Стопачин-» скорее всего ведет к названию населенного пункта вроде Стопачин, Стопачево или Стопачино. Такие топонимы встречаются в исторических областях Подляшья, Волыни или Галичины — там, где польский и украинский языки переплетались веками.

Если разбирать корень, то «стопа» в славянских языках означает «ступня» или «след». Однако в основе фамилии лежит не прямое прозвище «стопа», а скорее производное прилагательное или название поселения. Возможно, первым носителем фамилии был человек из деревни Стопачи (или Стопачин), а суффикс «-ский» указывал: «вот этот пан — из Стопачина». В польской ономастике такие фамилии часто давались по названию родового имения, и Стопачинские вполне могли быть мелкопоместной шляхтой, владевшей хутором или селом.

Менее вероятная, но не исключенная версия — прозвищное происхождение. В древнерусских говорах «стопа» могло означать не только ногу, но и меру длины, а также «шаг» или «поступь». Прозвище Стопака или Стопач могли дать человеку с тяжелой походкой или, наоборот, с особым, «чеканным» шагом. Однако суффикс «-ин-» в таком случае дал бы Стопачин, а не Стопач-ин-ский, что сложнее для объяснения. Поэтому топонимическая версия выглядит предпочтительнее.

В русской традиции фамилия Стопачинская встречается редко. Попасть в центральные губернии она могла с переселенцами из западных земель после разделов Польши или в ходе миграций XIX века. Сословно носители могли быть как бывшей шляхтой, потерявшей привилегии, так и мещанами или крестьянами, взявшими фамилию по месту выхода. Единого «родового гнезда» сегодня не прослеживается — фамилия рассеяна, что типично для польско-украинского пограничья.