Фамилия Супиханова — женская форма, образованная от мужской Супиханов. В основе лежит имя или прозвище Супихан, а сам способ образования — типичная русская модель с суффиксом -ов/-ев, указывающая на принадлежность: «чей сын?» — Супиханов. Если разбирать дальше, имя Супихан, скорее всего, составное. Первая часть — Супи-, может восходить к тюркскому корню «су» (вода, река) или к арабскому «суфи» (мистик, аскет, человек в грубой шерстяной одежде). Вторая часть — -хан, широко распространённый тюркский титул, означающий правителя, владыку, а в составе имён — уважительное обращение, почти как «господин» или «князь». Таким образом, Супихан могло означать «водный хан» (если от «су») или «хан-суфий» (если от «суфи»). Вторая версия исторически правдоподобнее: суфизм был влиятелен в тюркской среде, и прозвище «Суфи» нередко давали людям, связанным с религиозной практикой или отличавшимся аскетичным образом жизни, а добавление «хан» могло подчеркнуть уважение или социальный статус такого человека.

Географически фамилия Супиханова тяготеет к регионам с тюркским населением — Татарстан, Башкортостан, а также к районам Средней Азии, где распространены имена с компонентом «хан». В русских документах фамилия могла фиксироваться в разное время, но её редкость говорит о том, что родоначальник был заметной фигурой в своей общине, раз прозвище закрепилось в качестве фамилии. Сословная принадлежность предков могла быть разной: от крестьян до купцов или духовных лиц, но без конкретных архивных записей точнее сказать нельзя. Особенность фамилии — в сочетании арабского религиозного термина и тюркского титула, что отражает культурный синтез, характерный для волжских татар и других тюркских народов, принявших ислам.