Фамилия Супроткина образована от личного имени или прозвища Супротка, и у её происхождения есть две основные версии. Первая связывает имя Супротка с каноническим именем Софроний. Это белорусско-украинский производный, народный вариант имени, которое в переводе с греческого означает «благоразумный». Покровителями имени считаются патриарх Иерусалимский Софроний и архиепископ Кипрский Софроний. Скорее всего, основатель рода Супроткиных происходил из простого сословия: в крестьянской среде церковное имя часто искажалось до неузнаваемости, обрастая местными формами.

Вторая версия отталкивается от прозвища, а не от имени. Она возводит основу к старинному нарицательному слову «супрун» — так в некоторых говорах называли ворчливого, угрюмого человека. Здесь срабатывает характерный для народной традиции приём «от обратного»: родители могли назвать ребёнка Супроткой, надеясь, что он вырастет жизнерадостным и отзывчивым. Такое имя-оберег должно было защитить мальчика от злых сил и дурного характера.

Какую версию считать правдоподобнее? Обе имеют право на существование, но первая выглядит убедительнее. Фамилия закрепилась в форме женского рода, что говорит о позднем оформлении, когда фамилии передавались и по женской линии. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Супроткина — дочь или жена Супротки. Сама основа при этом органично ложится в ряд адаптированных имён: Софроний — Софрон — Супрон — Супротка. Прозвище от «супруна» фонетически менее очевидно, хотя и не исключено полностью. Так или иначе, фамилия сохранила память о человеке, которого в быту звали Супроткой, и это имя звучит живо и по-народному.