Фамилия Сушонова — женская форма, в основе которой лежит мужская фамилия Сушонов. Разбирать её стоит с суффиксальной части: окончание -а указывает на принадлежность женщине, а основа Сушонов образована по стандартной русской модели притяжательных фамилий (чей? — Сушонов). Сам суффикс -ов- говорит о том, что фамилия возникла от имени или прозвища, оканчивающегося на твёрдый согласный.

Корень здесь — Сушон-. Это неканоническое имя, а скорее всего, прозвище или производная форма от крестильного имени. Наиболее вероятная версия: основа восходит к имени Сушон, которое является уменьшительно-ласкательной формой от Иосиф через народное произношение Осип (Осип → Осиш → Суш? — спорно). Прямее и логичнее считать Сушона вариантом имени Сусанна (женского, но в народной среде могло перейти в мужское прозвище) или же формой от глагола «сушить» — так могли прозвать сухопарого, худого человека. В говорах «сушон» означало нечто высохшее, истощённое — это могло быть и прозвище, и даже охранительное имя, данное слабому ребёнку, чтобы обмануть злых духов.

География фамилии Сушонова неширокая, но устойчивая: встречается преимущественно в Поволжье и на Урале, особенно в Пермском крае и Татарстане. Там же фиксируются однокоренные Сушонин, Сушонков. Это указывает на то, что фамилия могла возникнуть в среде крестьян или посадских людей, где прозвища по внешности или характеру были обычным делом.

В ономастических справочниках фамилия Сушонов не упоминается как широко распространённая или дворянская, что подтверждает её народное, непритязательное происхождение. Скорее всего, предок носителя фамилии был просто человеком с заметной сухощавостью — либо по комплекции, либо по характеру (сухой, сдержанный). Менее вероятна, но возможна связь с ремеслом: «сушить» могли рыбу, сено или кожу, но тогда прозвище звучало бы как Сушник или Сушарь, а не Сушон.

Таким образом, фамилия Сушонова — это типичная русская «прозвищная» фамилия, образованная через суффикс -ов от имени-прозвища Сушон. Её носительницы — потомки людей, которых в XVI–XVII веках называли сушёными, то есть худыми или сухими.