Фамилия Суйесин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа, скорее всего, иноязычная, а русский суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — сын или потомок человека, которого звали или прозывали Суйес.

Самая вероятная версия связывает фамилию с тюркскими корнями. В тюркских языках «су» означает «вода», а «ес» или «йес» может восходить к слову со значением «хозяин», «господин» или «владелец». Таким образом, «Суйес» могло быть прозвищем или именем, означающим «хозяин воды», «водяной». В среде татар, башкир или других тюркских народов такое прозвище могли дать человеку, жившему у реки, владевшему водяной мельницей или просто связанному с водой по роду занятий. Суффикс -ин в русском оформлении фамилии — типичное явление для фамилий, образованных от тюркских основ на территории бывшей Российской империи.

Менее вероятна, но возможна версия от финно-угорского корня. В некоторых диалектах коми или удмуртского языка «суй» означает «рука» или «плечо», а «ес» — может быть вариантом окончания. Тогда «Суйес» могло быть прозвищем, характеризующим физическую особенность или род занятий, например, «сильная рука». Однако эта гипотеза слабее, так как не объясняет конечное -син, которое в таком случае выглядело бы как Суйесов.

Географически фамилия Суйесин встречается крайне редко, в основном в Поволжье и на Урале — регионах, где веками соседствовали славянские и тюркские народы. Поскольку фамилия не имеет дворянского или церковного происхождения, её носители, скорее всего, были крестьянами или мещанами, получившими фамилию при переписях в XIX веке по имени или прозвищу своего предка.