Фамилия Суюсанов — редкий пример, где тюркская основа соединилась с русским патронимическим суффиксом. В отличие от большинства фамилий на -ов, образованных от крестильных имён или профессий, эта несёт в себе географический или этнический оттенок.

Корень фамилии — «Суюсан». Скорее всего, это тюркское сложное слово: «су» (вода) и «юсан» (полынь) или «йылан» (змея). Первая версия — «водяная полынь», прозвище человека, жившего у заросшего полынью водоёма. Вторая — «водяная змея», что могло указывать на ужа или на прозвище ловкого, изворотливого человека. Третья, менее вероятная, — искажённое тюркское имя Суюндук (радость) с аффиксом -сан.

Суффикс -ов указывает на то, что фамилия оформилась в русской среде, скорее всего, в XVI–XVII веках, когда в Поволжье и Приуралье шла активная ассимиляция татарских, башкирских и ногайских родов. Предок Суюсановых мог быть крещёным татарином или башкиром, получившим фамилию по прозвищу отца.

Географически фамилия тяготеет к Оренбургской области и Башкортостану. Встречается также у казахов, но с иным окончанием (Суюсанов — русифицированная форма). Среди носителей нет известных исторических личностей, что только подтверждает её крестьянское или казачье происхождение.

Словообразовательная модель проста: прозвище Суюсан + русский суффикс принадлежности -ов. Ударение в фамилии плавающее: в речи чаще ставят на второй слог (Сую́санов), но по тюркской логике ударным должен быть последний (Суюса́нов).