Фамилия Сюрдонкин — редкая и неочевидная. Её основа звучит нерусски, но суффикс -ин указывает на стандартную русскую модель образования: от прозвища или имени, оканчивающегося на -а/-я. Вопрос в том, что это за основа.

Самая правдоподобная версия — фамилия восходит к слову «сюрдон» или «сюрдонка». В говорах Русского Севера и Поволжья так называли глухого человека (от французского sourd — глухой, проникшего в диалекты через морскую или техническую терминологию). В словаре В. И. Даля «сюрдон» — «глухой, тугой на ухо». Прозвище Сюрдон могли дать человеку с плохим слухом, а его дети стали Сюрдонкиными. Суффикс -к- в основе (Сюрдонк-а) — типичный для русских обиходных форм: сначала прозвище Сюрдонка (уменьшительное или пренебрежительное), затем фамилия Сюрдонкин.

Вторая версия — топонимическая. В Псковской и Тверской областях встречаются микротопонимы типа «Сюрдонка» — так могли называть глухое место, лесной угол или болото. Переселенец из такой местности получал прозвище Сюрдонка, а потом и фамилию.

Третья гипотеза — искусственное происхождение. В XIX веке в духовных семинариях иногда давали фамилии по латинским или греческим корням. Surdus (лат. глухой) могло дать Сюрдонский или Сюрдонкин — как фамилию для ученика с плохим слухом или просто как «учёную» фамилию. Но это маловероятно: семинарские фамилии чаще оканчивались на -ский.

География фамилии узкая. Сюрдонкины встречаются в основном в Кировской области и Удмуртии — регионах, где были сильны старообрядческие общины и где сохранялась архаичная лексика. Возможно, предок носителя был крестьянином-северянином, получившим прозвище за глухоту или за жизнь в глухом углу.

Фамилия не имеет отношения к тюркским или финно-угорским языкам, хотя по звучанию может показаться инородной. Это чисто русская, диалектная фамилия, записанная через «ё» (Сюрдонкин, а не Сурдонкин), что тоже характерно для северных говоров.