Фамилия Сюсюгина — женская форма фамилии Сюсюгин, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса, потому что он сразу указывает на происхождение. Суффикс -ин в русских фамилиях означает принадлежность: «чей?» — Сюсюгин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Сюсюга. Такая модель типична для северных и центральных регионов России, где фамилии на -ин широко распространены.

Основа — прозвище Сюсюга. Вероятнее всего, оно образовано от глагола «сюсюкать» — говорить невнятно, шепелявить, сюсюкаться. В русских говорах «сюсюка» — это человек с нечёткой речью или тот, кто любит сюсюкать, то есть нежно, по-детски обращаться. Прозвища по особенностям речи давали часто: Сюсюка, Шепель, Картавый — все они фиксировали заметную черту, которая закреплялась за человеком и переходила к его детям.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом «сюсюга» в значении «сырость, слякоть» или «вялый, мокрый человек». В некоторых говорах так называли плаксу или нытика. Однако первая версия (от речи) более правдоподобна: звукоподражательные прозвища в русской ономастике встречаются чаще, чем метафорические от погоды.

Фамилия Сюсюгин — нечастая. Встречается в Поволжье и на Урале, что подтверждается данными переписей. Сословной привязки нет: крестьяне и мещане могли получить такое прозвище одинаково легко. В дореволюционных записях Сюсюгины фиксируются в Симбирской и Вятской губерниях.

Есть интересная деталь: фамилия сохранила архаичную огласовку без «окающего» смягчения. Если бы прозвище дали в южнорусских говорах, оно могло бы звучать как «Сясюга» или «Сисюга». Твёрдый «сю» указывает на севернорусскую или среднерусскую основу.

Таким образом, Сюсюгина — это фамилия, которая прямо говорит о предке: его звали Сюсюгой, скорее всего, за манеру говорить или за характер. Никакой тайны, только живая речь, застывшая в документе.