Фамилия Сесюгина — женская форма фамилии Сесюгин, которая образована по самой распространённой в русском языке модели: от прозвища или имени с помощью суффикса -ин. Суффикс -ин, в отличие от -ов/-ев, указывает на принадлежность к человеку, чьё имя или прозвище оканчивалось на -а или -я. В данном случае основа — Сесюга.

Что могло означать это слово? Тут есть несколько версий, и самая вероятная связана с диалектной лексикой северных и центральных областей России. Слово «сесюга» или «сесюка» в некоторых говорах означало шепелявого человека, того, кто «сесюкает», то есть не выговаривает шипящие или свистящие звуки. Прозвища по дефектам речи давали часто и охотно — так появлялись Шепель, Заика, Гугня, Картавый. Сесюга из того же ряда. Человек, получивший такое прозвище, мог быть говорливым, но с характерным выговором, и это бросалось в глаза соседям.

Менее распространённая версия возводит основу к личному имени Сеся — уменьшительной форме от Семён (в старину — Симеон) или от редкого имени Севастьян. В таком случае Сесюга — это ласкательное или обиходное производное, а фамилия означает «сын Сесюги», то есть потомок человека по имени Сеся. Однако для этой версии меньше оснований: суффикс -юга в русских прозвищах чаще встречается именно в экспрессивных, характеризующих словах, а не в уменьшительных формах имён.

Географически фамилия Сесюгин встречается нечасто, но имеет отчётливую привязку к Вятскому региону (современная Кировская область) и к некоторым районам Поволжья. Это типичная фамилия крестьянского сословия — её носители, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами, а не дворянами. В дворянских родословных книгах фамилия не зафиксирована.

Интересная деталь: написание фамилии с буквой «ю» (Сесюгин, а не Сесягин) указывает на то, что в основе лежал именно звук [у] — «Сесюга», а не «Сесяга». Это дополнительный аргумент в пользу прозвищной версии: глагол «сесюкать» имеет устойчивое произношение через «ю». Так что, скорее всего, предок носительницы фамилии был человеком с характерной речью, и его меткая кличка закрепилась в роду.