Фамилия Сесюнина образована от прозвища Сесюня, и, судя по всему, корни её лежат в псковских и тверских говорах. Там словом «сесем» (или «сесюней») называли человека, который любил передразнивать окружающих, — этакого насмешника и шута. Прозвище цепкое, яркое: оно мгновенно описывало манеру поведения, и закрепиться такое могло за человеком с артистичным, но колким характером, который не упускал случая спародировать соседа или приятеля.

Впрочем, есть и другая версия, более спокойная. В тех же говорах бытовало слово «сесь» — «сейчас, теперь». Если прозвище пошло от него, то Сесюней могли называть человека, который живет одним днем, не заглядывает в будущее и не строит долгих планов. Такой человек словно застрял в текущем моменте, и окружающие подметили эту черту. Эта гипотеза выглядит правдоподобнее, чем экзотическая связь с итальянской монетой сесино: вряд ли крестьянин из-под Пскова получил прозвище в честь денежной единицы чужой страны, скорее уж тут сыграла роль местная лексика.

Сама фамилия построена по простой и понятной модели: прозвище Сесюня плюс суффикс -ин, который указывает на принадлежность. То есть Сесюнина — это «дочь или жена Сесюни», а для мужской линии форма была бы Сесюнин. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ, и она говорит о том, что фамилия формировалась в среде, где семейные отношения фиксировали через имя главы рода.

Если отталкиваться от первой версии, то предок носительницы этой фамилии был, скорее всего, человеком заметным в деревенском обществе — не злым, а именно потешным, тем, кто умел рассмешить и повторить чужую интонацию. Во втором случае — это был человек беспечный, возможно, даже слегка легкомысленный, но не обиженный судьбой.

Точных сведений о том, когда именно фамилия закрепилась, нет, но по своему типу она относится к числу относительно ранних, возникших в среде крестьянства и посадских людей. Встречается она редко, что неудивительно: прозвища с корнем «сес-» локальны и не получили широкого распространения за пределами северо-западных говоров.