Фамилия Табутаров — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять, откуда она взялась, нужно присмотреться к её основе — «Табутар». Скорее всего, это не славянское, а тюркское имя или прозвище. В тюркских языках есть слово «табу» (tabu) — «находка», «добыча» или «дар». От него образовано имя Табутай или Табутар, которое могли дать ребёнку, родившемуся после долгого ожидания или «найденному» (например, подкидышу). Суффикс -ар в таких именах часто указывает на деятеля или обладателя признака: Табутар — буквально «тот, кто является находкой» или «дарёный».

Русский суффикс -ов превратил это имя в фамилию по стандартной модели: «чей?» — Табутаров, то есть «сын Табутара». Такая модель типична для фамилий, возникших в среде, где смешивались русские и тюркские традиции — в Поволжье, на Урале, в Сибири или среди казачества. Там часто записывали тюркские имена с русским окончанием.

Вторая, менее вероятная версия, связывает фамилию с кавказскими языками. В некоторых из них «табу» означает «гора», а «тар» — «живущий», то есть «живущий в горах». Но это скорее народная этимология: для фамилии на -ов такое происхождение нетипично, так как кавказские фамилии обычно оформляются иначе.

В любом случае, носитель фамилии Табутаров может быть потомком человека, которого в своём окружении называли по имени-прозвищу Табутар. Скорее всего, предок был незнатного происхождения — крестьянин, ремесленник или казак, так как фамилии на -ов из личных имён без суффикса -ский редко указывают на дворянство. Географически фамилия сегодня встречается единично, в основном на юге России и в странах Средней Азии, что подтверждает её восточные корни.