Фамилия Тахттыходжаева — редкий случай в русском ономастиконе: она не славянского происхождения, а восходит к тюркско-персидскому миру. Её основа — мужское имя Тахттыходжа, которое состоит из двух частей. Первая, «тахт», в персидском и тюркских языках означает «трон», «престол», «власть» (ср. с «тахт» в «падишах» — буквально «владыка на троне»). Вторая часть — «ходжа» (арабское «хваджа») — почётный титул, который в исламском мире давали купцам, учёным, духовным лицам, а также потомкам пророка Мухаммеда. Таким образом, имя Тахттыходжа можно перевести как «трон ходжи» или «власть ходжи» — то есть имя, подчёркивающее высокий статус или духовный авторитет носителя.

Фамилия образована по модели, типичной для фамилий народов Средней Азии: к основе мужского имени добавлен суффикс -ев/-ова. В русской паспортной системе такие фамилии часто получали окончание -ев/-ова, адаптируя местную антропонимию к стандартам Российской империи и СССР. Тахттыходжаева — женская форма; мужская — Тахттыходжаев. Суффикс -ев здесь не несёт значения принадлежности (как в русских фамилиях вроде «Иванов»), а выступает формальным показателем фамилии в русском документообороте.

Географически фамилия тяготеет к Узбекистану и Таджикистану, где имя Тахттыходжа изредка встречается. В России она крайне редка, и её носители — почти наверняка потомки выходцев из Центральной Азии. Социальный контекст: предки человека с такой фамилией могли быть из среды уважаемых ходжей — духовных наставников или зажиточных торговцев, но точное сословие установить трудно, так как фамилия не фиксировалась в дворянских родословных книгах Российской империи.

Интересная деталь: написание «Тахттыходжаева» с двумя «т» в середине — не опечатка, а отражение тюркского произношения, где «тахт» произносится с долгим согласным. Встречаются варианты «Тахтыходжаева» (с одной «т»), но исходная форма с удвоением точнее передаёт звучание исходного имени. Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то «Ходжаев» и «Ходжаева» — гораздо более распространённые варианты в Средней Азии; «Тахттыходжаева» — это как раз тот случай, когда имя-основа содержит дополнительный корень, делающий фамилию уникальной.