Фамилия Таушунаева — редкий случай, когда географическая привязка и этнический компонент почти наверняка перевешивают любые другие версии. Корень фамилии — «таушун» — с высокой вероятностью восходит к тюркскому слову «таушан», что означает «заяц». В башкирском, татарском и казахском языках это слово звучит именно так. Форма «Таушунаев» (с «у» во втором слоге) характерна для башкирской ономастики: в башкирском языке закон сингармонизма и специфика произношения могли дать вариант с «у» вместо «а». Таким образом, фамилия образована от прозвища Таушун («Заяц») по стандартной русской патронимической модели с суффиксом -ев: Таушунаев буквально — «сын Зайца».

Модель образования фамилии — классическая для народов Поволжья и Урала, оказавшихся в зоне русского административного и языкового влияния. Суффикс -ев присоединили к основе, оканчивающейся на согласный, чтобы получить русскую фамилию. Это говорит о том, что предки носителя фамилии, скорее всего, были башкирами или татарами, но их запись в метрических книгах или переписях велась на русском языке по правилам русской грамматики. Обратите внимание: фамилия не оканчивается на -ов, а на -ев, что указывает на мягкий или шипящий звук в конце основы (в данном случае «н» — не шипящий, но в русской традиции после «н» и «р» в тюркских фамилиях часто писали -ев, а не -ов, из-за особенностей произношения).

Прозвище «Заяц» в тюркской среде — не обязательно указание на трусость. Чаще так называли быстрого, юркого человека, либо того, кто был хорошим охотником на зайцев. В кочевых и полукочевых культурах заяц — промысловый зверь, и прозвище могло быть профессиональным. Встречаются и более редкие версии: «таушун» может быть искажением от «тау» (гора) и «шун» (какой-либо суффикс), но лингвистически версия с зайцем выглядит убедительнее, так как слово «таушан» широко распространено в тюркских языках, а «таушун» — его закономерный диалектный вариант.

Фамилия несёт чёткий отпечаток региона. Она почти наверняка происходит из юго-восточных районов Башкортостана или из соседних областей Челябинской и Оренбургской, где компактно живут башкиры. Женская форма Таушунаева — это не отдельная фамилия, а грамматический вариант мужской фамилии Таушунаев, закреплённый за женщинами. Поскольку фамилия редкая, её носители, скорее всего, являются потомками одного рода, и генеалогическое древо может быть прослежено по метрическим книгам башкирских деревень конца XIX — начала XX века.