Фамилия Тауткус — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение почти наверняка не русское, а литовское или латышское. В славянских языках нет корня «таут-», который бы легко лёг в основу прозвища или имени. Зато в балтийских языках этот корень прозрачен: литовское «tauta» и латышское «tauta» означают «народ», «племя», «нация». Таким образом, исходное слово «Таутас» или «Таута» — это древнее балтийское личное имя, которое давали мальчикам как пожелание быть частью своего народа, защитником рода. Фамилия Тауткус образована от этого имени с помощью уменьшительно-ласкательного суффикса «-кус» (лит. -kus, латыш. -kis), который в балтийских языках часто придаёт значение «сын такого-то» или «маленький, младший». Сравните с распространёнными литовскими фамилиями: Адомайтис (сын Адомаса), Янавичюс (сын Янаса). Тауткус, соответственно, — «сын Таутаса» или «маленький Таутас».

Встречается эта фамилия в основном на северо-западе России, в Калининградской области, Псковщине, а также в Литве и Латвии. Исторически носители фамилии Тауткус — скорее всего, выходцы из балтийских крестьян или мелких ремесленников, которые в XIX — начале XX века переселялись вглубь Российской империи. Дворянской эта фамилия не была: суффикс «-кус» характерен для простонародных, нешляхетских фамилий в Великом княжестве Литовском. После присоединения балтийских земель к России фамилию могли записать на русский лад, но она сохранила исходное окончание, не перейдя в типичное -ов или -ин. Поэтому Тауткус — это живое свидетельство балтийского влияния на антропонимику Северо-Запада России, а не случайная или искусственная фамилия.