Фамилия Тимокина — женская форма, мужской вариант — Тимокин. Она образована по стандартной для русских фамилий модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Тимокин, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Тимока.

В основе фамилии лежит имя Тимока — это разговорная, обиходная форма крестильного имени Тимофей (от греческого «почитающий Бога»). В русской народной традиции такие сокращения, как Тимока, Тимоха, Тима, были обычным делом: полное имя в быту упрощали, а затем от этого упрощённого варианта и образовывали фамилию. Суффикс -ка в имени Тимока придавал ему оттенок ласкательности или просторечия — так могли называть человека в семье или в деревенском кругу.

Мужская фамилия Тимокин могла также закрепиться как прозвище по отцу: в документах XVII–XVIII веков нередко писали «Ивашка Тимокин», имея в виду «Ивашка, сын Тимоки». Со временем прозвище перешло в наследственную фамилию.

Фамилия эта не относится к числу самых распространённых, но встречается в разных регионах России. Поскольку имя Тимофей было популярно среди всех сословий, предки Тимокиных могли быть и крестьянами, и посадскими людьми, и мещанами. Дворянских родов с такой фамилией в исторических источниках не отмечено — скорее всего, это фамилия простонародная.

Следует различать фамилию Тимокин и похожую Тимкин: во втором случае основа — имя Тимка, что ещё более фамильярная форма. Тимокин звучит мягче, с сохранением старого уменьшительного суффикса -ок-. Такие детали помогают понять, как в русской ономастике варьировалась одна и та же основа в зависимости от говора и местных привычек.