Фамилия Тобахан — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычных русских суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу указывает: перед нами не исконно русская фамилия, а заимствованная или возникшая на стыке культур. Скорее всего, её корни лежат в тюркских или кавказских языках, где «тоба» или «тюба» может означать «род», «племя» или «колено», а «хан» — титул правителя. Таким образом, Тобахан — это составное имя-прозвище, которое могли дать человеку, принадлежащему к знатному роду или ведущему своё происхождение от хана. В тюркской традиции такие сложные имена нередко фиксировали социальный статус или родословную.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная, — связь с топонимом. В Азербайджане, Дагестане и некоторых районах Средней Азии встречаются селения с названием Тоба или Тобахан. Фамилия могла закрепиться за выходцем из такого места: в прошлом переселенцам часто давали прозвище по названию покинутой деревни. Если это так, то основа «Тоба» восходит к местному географическому термину, а «хан» — уже позднее добавление или часть исходного названия.

С точки зрения словообразования, фамилия Тобахан — это архаичная модель без патронимического суффикса, характерная для многих народов Кавказа и Поволжья. В русском контексте она могла сохраниться в неизменном виде у татар, башкир или кумыков, чьи фамилии нередко оканчиваются на «-хан» (например, Алихан, Магомедхан). Встречаемость фамилии крайне низкая, и в исторических документах она почти не фиксируется — это говорит о том, что её носители составляли немногочисленную локальную группу.

Единственное, что можно сказать с уверенностью: фамилия Тобахан не имеет отношения к славянским корням и не происходит от христианского имени. Это яркий пример того, как в русском языке оседают иноязычные прозвища, не менявшие формы веками. Носителям фамилии стоит искать свои истоки в тюркской или кавказской генеалогии, а не в центральных областях России.