Фамилия Тобахон — редкая и нестандартная для русского уха. На первый взгляд она кажется искусственной или заимствованной, и это ощущение не обманывает. В её основе лежит не славянский корень, а восточное имя или прозвище, что сразу выделяет её из массы фамилий на -ов, -ин или -ский.

Скорее всего, фамилия Тобахон происходит от мужского имени Тобахон (или близкого к нему Тоба-хон), распространённого в тюрко-татарской и среднеазиатской среде. Компонент «хон» (хан) в таких именах — титул правителя, который со временем стал частью личного имени (например, Ахметхан, Тохтахон). Первая часть «Тоба» может восходить к арабскому слову «тауба» (покаяние) или к тюркскому «тоба» (стойкий, крепкий). Таким образом, Тобахон — это «крепкий хан» или «покаявшийся правитель». Фамилию образовали по русской модели: к основе Тобахон добавили нулевой суффикс, то есть оставили имя без изменений, что типично для поздних фамилий, возникших у народов, вошедших в состав Российской империи.

В русском контексте фамилия почти не встречается. Её носители — потомки выходцев из Татарстана, Башкортостана, Казахстана или Средней Азии, которые в XIX–XX веках переселились в центральные регионы России. Сословно это могли быть крестьяне или ремесленники — фамилии такого типа редко давались дворянам. Из-за редкости фамилия не попала в основные ономастические словари (Унбегауна, Никонова), но её структура ясно указывает на восточное происхождение.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Тобахон стоит в одном ряду с Тобаев, Тобаков, Тобашев — все они образованы от тюркских имён с корнем «тоба». Но именно форма без суффикса (Тобахон) говорит о том, что фамилию зафиксировали поздно, когда имя уже перестало быть только именем и перешло в разряд фамилий без дополнительной переделки. Это делает её историческим документом: она сохранила исходное звучание имени, которое в других фамилиях уже «обрусело» через суффиксы.