Фамилия Тобеков — пример фамилии, где за основу взято не славянское имя или прозвище, а тюркское личное имя. В русском языке фамилия появилась через присоединение патронимического суффикса -ов, который указывает на принадлежность: «чей?» — Тобеков, то есть сын Тобека.

Само имя Тобек — это краткая, обиходная форма от более полного тюркского имени, скорее всего, от Тобет или Тобекбай. Корень «тоб-» в тюркских языках многозначен. В казахском и других кыпчакских языках «тоб» означает «куча», «груда», «насыпь», а также «толпа», «сборище». В переносном смысле такое имя могли дать ребенку, чтобы он был здоровым, крепким, как насыпь, или чтобы вокруг него всегда были люди, он был общительным и влиятельным. Вторая версия связывает имя с тюркским «тобе» — «вершина», «холм», что тоже символизировало силу и высоту положения.

Географически фамилия Тобеков чаще всего встречается среди казахов, а также у народов, испытавших сильное тюркское влияние — башкир, татар, ногайцев. В русских документах XVIII–XIX веков, когда проводилась массовая фиксация фамилий у кочевых народов, имя Тобек записывали как есть, а затем уже его потомки получали фамилию на русский манер. Поэтому предки современных Тобековых, скорее всего, не были дворянами или священниками, а являлись скотоводами, воинами или рядовыми общинниками, получившими фамилию по имени отца при переходе к оседлости или при записи в метрические книги.

В русском написании фамилия могла варьироваться: встречаются варианты Табеков, Тубеков. Это связано с тем, что тюркский звук «ө» (близкий к русскому «ё») на слух воспринимался по-разному. Но форма Тобеков — самая распространенная и закрепившаяся в официальных документах. Фамилия не имеет отношения к славянским корням или библейским именам — это чистый пример тюркского влияния на русскую ономастику, где имя-прозвище стало родовым знаком.