Фамилия Тохнина — женская форма, образованная от мужской Тохнин. В русской традиции такие фамилии на -ин закреплялись за женщинами при рождении или в браке, а сам род носит фамилию Тохнины. Мужской вариант Тохнин встречается заметно реже, чем распространённые фамилии на -ов, и это уже указывает на особенность: суффикс -ин в русских фамилиях обычно присоединялся к основам, оканчивающимся на -а или -я (как Пушкин от Пушка, Кузьмин от Кузьма). Здесь основа — Тохна.

Что такое Тохна? Самое прямое объяснение — прозвище или нецерковное имя человека. В русских говорах слово «тохнуть» означало «чахнуть, сохнуть, болеть», а «тохлый» — «хилый, слабый, заморенный». Тохной могли назвать болезненного ребёнка или взрослого с тщедушным телосложением. Такие «обережные» имена давали нарочно, чтобы отвести от ребёнка настоящую хворь: назовут хилым — вырастет здоровым. В этой логике Тохна — не обидное прозвище, а охранительное.

Есть и другая версия, хотя она менее вероятна. В некоторых северных и сибирских говорах «тохнуть» фиксировалось в значении «таять, оттаивать» (о снеге, земле). Тогда Тохна могло быть прозвищем человека, связанного с оттепелью, сыростью или, возможно, с характером — «оттаивающий», незлобивый. Но эта гипотеза слабее, потому что бытовые прозвища чаще брали от внешности или здоровья, чем от погодных явлений.

Географически фамилия Тохнины привязана к северо-западу России. В писцовых книгах и метриках она встречается в Новгородской, Псковской и Вологодской губерниях. Это область, где активно бытовали акающие говоры и где слово «тохлый» было в ходу. По сословной принадлежности Тохнины — почти наверняка крестьяне или посадские люди: фамилии на -ин от прозвищ с бытовой семантикой редко встречались у дворянства, которое предпочитало модели на -ский или книжные основы.

В современной России фамилия Тохнина остаётся редкой. Если сопоставить её с однокоренными — Тохин, Тохов, Тохинский — видно, что все они отходят от одного корня, но суффикс -н- в Тохнине указывает на конкретное лицо: Тохна, а не просто «тохлый». Это фамилия-прозвище, которая сохранила память о внешности или здоровье далёкого предка, и в этом её ценность для потомков.