Фамилия Толонкина — женская форма фамилии Толонкин, и её происхождение напрямую связано с прозвищем, которое дали предку по мужской линии. В основе лежит слово «толонка» или «толокно» — так в русских говорах называли толокно, то есть муку из поджаренного овса, которую запаривали кипятком и ели. Прозвище Толонка (или Толокно) мог получить человек, который занимался изготовлением или продажей толокна, либо тот, кто особенно любил это кушанье.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Толонкин буквально означает «сын Толонки» или «человек из семьи Толонки». Это типичная модель образования русских фамилий от прозвищ, оканчивающихся на -а или -я. В данном случае прозвище Толонка (с ударением, скорее всего, на первый слог) перешло в фамилию без изменений основы.

Интересная деталь: в некоторых северных и сибирских говорах «толонка» имела дополнительное значение — «лентяй», «неповоротливый человек», поскольку приготовление толокна считалось простой, не требующей хлопот едой. Если предок носителя фамилии жил в этих краях, прозвище могло указывать не на род занятий, а на черту характера. Однако версия с ремеслом выглядит более вероятной: прозвища по профессии давали чаще, чем по бытовым привычкам.

Фамилия Толонкина встречается редко, преимущественно в центральных и северных областях России. Её однокоренные «родственники» — фамилии Толокнов, Толоконников, Толоконцев — образованы от того же корня, но с разными суффиксами, что говорит о широкой распространённости прозвища в разных диалектных вариантах. В отличие от них, форма Толонкин сохранила более архаичное звучание, близкое к севернорусскому произношению слова «толокно» как «толонно».