Фамилия Томбаиди — редкий случай в русском ономастиконе, где греческое происхождение читается почти без искажений. Её основа — греческое слово «томбас» (τόμβος), то есть «могила, гробница». Суффикс -иди (в русской передаче часто -иди, -идис) — классический патронимический формант новогреческого языка, соответствующий русскому «сын такого-то». Буквально Томбаиди означает «сын могильщика» или «сын того, кто при могиле».

В Греции такие фамилии были распространены среди людей, чья работа была связана с кладбищем: сторожей, копателей могил, а иногда и священников, служивших на погосте. В русскую среду фамилия попала, скорее всего, с волнами греческой эмиграции — в XVIII–XIX веках греки селились в Причерноморье, на Кубани, в Одессе и Мариуполе. Там фамилия могла закрепиться без изменений, так как греческие общины долго сохраняли язык и традиции.

Интересная деталь: в отличие от многих фамилий на -ов/-ев, которые в России «переплавляли» иноязычные корни, Томбаиди осталась в исходной греческой форме. Это говорит о том, что носители фамилии долго не ассимилировались полностью или держались компактно. Встречается вариант Томбаидис — с конечным «с», который в русском языке часто отбрасывали, подстраивая под местное произношение.

В русском контексте фамилия не имеет никакого отношения к русским словам «томить» или «байда» — это чисто греческая основа. Если ваш предок носил такую фамилию, он почти наверняка был греком-понтийцем или выходцем из Малой Азии, а его профессия или место жительства были связаны с кладбищенским делом. Впрочем, могло быть и прозвище по мрачному нраву или внешности, данное в насмешку, — такое тоже случалось.