Фамилия Томскова — женская форма фамилии Томсков, и её разбор стоит начать с необычного суффикса. В русских фамилиях чаще встречаются -ов/-ев, -ин или -ский. Суффикс -ск- здесь не топонимический (как в Томский, от города Томск), а принадлежит к редкой модели прозвищных фамилий. Основа «Томск» могла возникнуть от прозвища Томска — человека, который либо был родом из Томска (но тогда логичнее была бы фамилия Томский), либо получил прозвище за что-то, связанное с этим городом: например, торговал с сибирскими землями, носил одежду «по-томски» или имел там родню. Однако более вероятна другая версия.

Фамилия Томсков (и Томскова) может восходить к неканоническому имени или прозвищу Том, Томко. В старых русских говорах слово «тома» означало «смирный, тихий человек» или «увалень». Суффикс -ск- в таком случае выполнял роль патронимического показателя: Томсков буквально «сын Томка». Это редкая словообразовательная модель, характерная для северных и сибирских областей, где фамилии на -сков (вместо обычных -ков) фиксировались у крестьян и посадских людей. Например, аналогично построены фамилии Морозов — Морозсков, но Томсков сохранила более архаичный облик.

Если принять версию с прозвищем Томка (от «томный» — утомлённый, вялый), то предок носительницы фамилии мог быть человеком медлительным, спокойным, возможно, даже флегматичным. В ономастических работах Б. Унбегауна и В. Никонова такая модель упоминается как маргинальная, но встречающаяся в документах XVI–XVII веков по Северной Двине и Вятке. Географически фамилия Томскова сегодня редка, её можно встретить в Пермском крае, на Урале и в Западной Сибири — что косвенно подтверждает связь с сибирским контекстом.

В сословном плане носители фамилии Томсковы, скорее всего, были государственными или черносошными крестьянами, реже — мещанами. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. Интересно, что фамилия не перешла в форму Томский, хотя это было бы естественнее для указания на город — значит, прозвищное происхождение здесь убедительнее топонимического.