Фамилия Томзиков — редкий пример, где фамильный суффикс -ов присоединён к основе, которая сама по себе уже является уменьшительной формой. В основе лежит имя или прозвище Томзик. Это, в свою очередь, уменьшительное от имени Тома, которое в русской традиции может быть как краткой формой от Фома (через просторечное Фома → Фомка → Томка), так и прямым заимствованием из западных языков (Томас, Том). В любом случае, Томзик — это ласкательное, «домашнее» обращение к человеку, носившему такое имя.

Если отталкиваться от имени Фома, то фамилия Томзиков оказывается в одном ряду с Фоминым, Фомичёвым, Фомкиным, но с заметным фонетическим сдвигом. В говорах, где «ф» заменялось на «т» или «хв», имя Фома легко превращалось в Тома, а затем обрастало уменьшительными суффиксами. Такой переход характерен для севернорусских и некоторых среднерусских диалектов. Встречается и фамилия Томзин, которая образована по той же модели, но с другим суффиксом.

Географически фамилия Томзиков привязана к регионам, где были распространены такие диалектные формы. По данным современных справочников, носители фамилии встречаются в центральной России, а также в Поволжье, в частности в Нижегородской области. Это совпадает с ареалом, где имя Фома в бытовой речи могло звучать как «Тома». Второй, менее вероятный, но возможный вариант — происхождение от прозвища Томзик, данного человеку небольшого роста или с мягким характером, но имя как источник выглядит убедительнее.

Сословная принадлежность предков Томзиковых, скорее всего, крестьянская или мещанская. Фамилии на -ов с основой от уменьшительного имени обычно возникали в среде, где людей называли не по полному церковному имени, а по домашнему, обиходному прозвищу. Дворянские фамилии редко строились от таких «уменьшительных» форм.