Фамилия Тонжераков — редкая и с первого взгляда неочевидная по происхождению. Чтобы понять её корень, нужно разобрать словообразовательную модель. Фамилия явно тюркская по основе, что типично для многих русских фамилий, особенно из регионов Поволжья, Урала и Сибири, где столетиями жили бок о бок русские и тюркские народы. Суффикс -ов указывает на типично русское оформление фамилии по модели «чей?» — то есть «сын Тонжерака». Основа «Тонжерак» — это личное имя или прозвище.

Скорее всего, в основе лежит тюркское имя Тонжер (или Танжер) с добавлением уменьшительно-ласкательного аффикса -ак, характерного для многих тюркских языков (ср. Ишак, Кунак). Само имя Тонжер может восходить к двум корням. Первый — «тон» (тюрк. «шуба, одежда»), что могло указывать на род занятий скорняка или торговца мехами. Вторая, более вероятная версия — «тон» в значении «холодный, морозный», а «жер» (жар) — «земля». Вместе имя могло означать «холодная земля» или «мерзлота» — такое имя могли дать ребёнку, родившемуся в суровую зиму, или человеку с холодным, сдержанным характером. В тюркской ономастике распространены имена, описывающие природные явления.

Есть и другая гипотеза, менее популярная, но имеющая право на существование: искажение фамилии Тонжераков от Танжераков, где корень «танг» (утро, заря) — имя Танжер означало бы «рассветный». Однако написание через «о» (Тонжераков) встречается чаще, что говорит в пользу первой версии с «холодом». Географически фамилия тяготеет к южным регионам России, где сильны следы ногайского и казахского влияния (Астраханская область, Ставрополье, Оренбуржье).

Таким образом, предок носителя фамилии Тонжераков, скорее всего, был тюркоязычным человеком, которого в русских документах записали по имени его отца — Тонжерака. Само имя, вероятно, отражало либо внешнее обстоятельство (зимнее рождение), либо свойство характера. Фамилия недворянская, крестьянская или казачья, что подтверждается её прозрачной патронимической формой без приставок и типичных дворянских суффиксов.