Фамилия Топрыкин образована по классической русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: Топрыкин буквально значит «сын Топрыки» или «человек из семьи Топрыки». Основа фамилии — прозвище Топрыка, а оно, в свою очередь, связано с глаголом «топорщиться» или «топыриться». Так в старину могли назвать человека с взъерошенными волосами, того, кто ходил с вызывающим, задиристым видом, либо просто неуступчивого и упрямого в споре. В говорах встречались и родственные слова: «топырь» — задира, «топырка» — что-то торчащее, вздутое. Таким образом, прозвище носило яркий, образный характер и закреплялось за человеком по внешности или повадке.

Именования, образованные по той же модели, что и фамилия Топрыкин, широко представлены в ономастике восточных, западных и южных славян. Славянские фамилии возникали от личного прозвища или от имени (христианского или языческого). В случае с Топрыкиным мы имеем дело с чисто прозвищной основой, без связи с крестильным именем, что типично для северных и центральных русских земель, где такие «домашние» имена бытовали особенно долго. Сравните с однокоренными фамилиями: Топоров, Топорков (от «топор», но это отдельная ветвь), а также Топырин, Топыркин — все они восходят к одному гнезду слов, но Топрыкин отличается редкой стяжённой формой: выпал гласный, и сочетание «пыр» упростилось до «пр». Это могло произойти в живой речи, где фамилию произносили быстро, либо уже в документах при фиксации.

Такое написание — с «р» после «п» — встречается реже, чем более «прозрачные» варианты, и потому фамилия легко узнаваема. Географически фамилия тяготеет к волжским и вятским регионам, где прозвищные фамилии на -ин особенно частотны. Точных данных о первых носителях в открытых источниках нет, но по модели образования фамилия могла сложиться не позднее XVII века, когда прозвища окончательно закрепились за потомками. Сословно предки Топрыкиных, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми: прозвища такого бытового склада редко встречались у дворян, которые чаще брали фамилии от вотчин или крестильных имён.