Фамилия Трахенберг — одна из тех, что сразу выдают своё немецкое или еврейское (ашкеназское) происхождение. Она относится к так называемым «топонимическим» фамилиям, то есть образованным от названия места, где жил или откуда был родом первый носитель. В основе лежит немецкое словосочетание «Trahenberg» или «Trachberg», что дословно переводится как «гора дракона» (от «Trache» — устаревшее «дракон» и «Berg» — гора). Впрочем, более вероятно, что это не мифический образ, а искажённое название конкретного поселения.

В Германии и Австрии есть несколько реальных населённых пунктов с похожими названиями: например, Трахенберг (Trahenberg) в Баварии или Трахберг (Trachberg) в Силезии (ныне территория Польши). Жители таких мест получали фамилию по принципу «откуда родом». В Российской империи фамилия Трахенберг закрепилась в основном среди еврейского населения черты оседлости (западные губернии, Царство Польское), где была принята обязательная фиксация фамилий в начале XIX века. Немецкие колонисты, переселявшиеся в Россию при Екатерине II, тоже могли привезти эту фамилию, но среди них она встречается реже.

Суффикс в фамилии отсутствует — это чистая основа, что типично для немецких фамилий на -berg (ср. Розенберг, Гольдберг). В русском языке фамилия склоняется как существительное мужского рода (Трахенберга, Трахенбергу), но в бытовой речи часто остаётся неизменяемой. Интересно, что в документах XIX века встречаются варианты написания: Трахенберг, Трахберг, Трахенбург — это следствие неграмотности писарей или адаптации к местному произношению.

Версия о происхождении от прозвища «трахен» (нем. «тащить, волочить») маловероятна: слово «tragen» в значении «носить» не дало бы устойчивой фамильной формы с «berg». Таким образом, основная и самая достоверная версия — географическая: предки носителя фамилии Трахенберг жили в местности с таким названием, а их потомки разнесли её по миру, сохранив память о горе, которая когда-то была их домом.