Фамилия Цебратенко — яркий пример украинской фамилии, образованной по модели, типичной для юго-восточных земель. Её основа — нецерковное имя или прозвище Цебрат, которое, скорее всего, происходит от украинского слова «цебро» (диалектное «цебер»). Так на Подолье и в центральной Украине называли деревянную бадью, ушат или ведро для воды. Прозвище Цебрат («тот, кто делает цебры» или «похожий на цебро») давали либо бондарю, либо человеку с плотной, коренастой фигурой.

Суффикс -енко — самый распространённый патронимический маркер на Левобережной Украине, означающий «сын» или «потомок». Таким образом, Цебратенко буквально — «сын Цебрата». Если бы фамилия формировалась в центральных или северных областях, она могла бы звучать как Цебратов (с русским суффиксом -ов) или Цебратюк (с волынским -юк). Именно суффикс -енко надёжно указывает на происхождение рода из исторической Полтавщины, Черниговщины или Слобожанщины.

Слово «цебро» имеет праславянские корни и родственно литовскому kibiras («ведро») и латышскому cebris («корыто»). В украинских говорах «цебро» также могло означать «глиняная миска» или «кормушка для скота». Поэтому прозвище Цебрат могло закрепиться за мастером, изготавливавшим такую посуду, или за хозяином, который держал много скота.

Стоит отметить, что фамилия Цебратенко не входит в списки дворянских родов Российской империи. Её носители, вероятно, происходили из казацкой старшины, мещан или зажиточных крестьян — тех сословий, где на рубеже XVII–XVIII веков активнее всего закреплялись фамилии на -енко. В современных украинских справочниках фамилия фиксируется как редкая, с концентрацией в Черкасской и Кировоградской областях, что подтверждает её региональную привязку к центральной Украине.