Фамилия Цитеркоп — это, по сути, упрощённое написание немецкой фамилии Цитеркопф. Такое сокращение конечного «ф» часто происходило при адаптации фамилии в русскоязычной среде, когда окончание теряло чёткое звучание. Сама фамилия Цитеркопф — потомок прозвища, которое носил предок, и расшифровывается оно довольно прозрачно.

Первый корень, Цитер, восходит к верхненемецкому слову sūter (через цепочку превращений sūter > sauter > seiter > zeiter > ziter), которое в основе своей означало «пришивать» или «шить». Второй корень, Копф, — от немецкого kopf («голова»). Но в составе прозвища это слово, вероятнее всего, использовалось не в прямом анатомическом смысле, а в переносном — «глава», «начальник», «руководитель». То есть буквально именование можно понять как «глава швейного дела».

Соединив эти два значения, получаем типичное «профессиональное» прозвище, указывающее на род занятий. Цитеркопфом, а затем и Цитеркопом, скорее всего, называли не простого портного, а человека, который стоял во главе ремесленного цеха — например, портных или сапожников. В средневековых немецких городах такие мастера пользовались весом и уважением, а их именования закреплялись за потомками уже как фамилии.

Стоит оговориться, что это основная и наиболее правдоподобная версия. Альтернативная трактовка, которая искала бы в основе какое-то личное имя или географическое название, выглядит слабее: слишком уж ясна профессиональная логика сложения «шить» + «голова». Поэтому с высокой долей уверенности можно говорить, что предки носителей фамилии Цитеркоп имели отношение к руководству швейным или сапожным ремеслом, а сама фамилия пришла в русский обиход из немецкоязычных земель.