Фамилия Цвиткова образована от прозвища, которое давали в южнорусских и украинских говорах. Основа — слово «цвит», то есть «цвет». В диалектах «цвиток» означало цветок, а «цвит» — цветение или сам цветущий побег. Прозвище Цвиток или Цвит мог получить либо человек, занимавшийся разведением цветов, либо крестьянин, живший в местности, где цвели сады, либо — по народной метафоре — кто-то румяный, цветущий лицом.

Суффикс -ов- указывает на типичную русскую модель образования фамилий от прозвищ: Цвит → Цвитов → Цвитова. Женская форма Цвиткова — это вариант для замужней женщины или дочери, тогда как мужская форма — Цвитков. Такая фамилия закрепилась в XIX веке, когда крестьянам и мещанам массово присваивали фамилии по прозвищам или занятиям.

Интересная деталь: фамилия Цвиткова и её мужской вариант Цвитков встречаются значительно реже, чем однокоренные Цветков или Цветкова. Причина — в диалектном происхождении. Если «цветков» — это литературная норма, то «цвитков» — характерный признак южнорусских и украинских говоров, где «ц» произносили вместо «ч» (цвит, цвисти). Поэтому носители фамилии Цвиткова с большой вероятностью родом из Курской, Воронежской, Белгородской областей или с Украины.

В дореволюционных документах фамилию могли записывать по-разному: Цвиткова, Цвитко́ва (с ударением на второй слог), а иногда и Цвіткова — под влиянием украинской орфографии. Единого написания не было до советской паспортизации 1930-х годов, когда вариант с буквой «и» закрепился как основной.

По социальному составу носители Цвитковых — в основном крестьяне и мещане, реже духовенство. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В современной России фамилия редкая, чаще встречается на юге и в центральном Черноземье.