Фамилия Цыпелян — редкий пример, где за привычным русским ухом суффиксом -ян скрывается не армянское происхождение, а, скорее всего, южнославянский или румынский след. Суффикс -ян в русских фамилиях встречается нечасто, но в бессарабских, молдавских и украинских записях XIX века он мог передавать окончание молдавской фамилии или адаптировать прозвище на русский лад. Если бы фамилия была армянской, её основа звучала бы иначе — например, Циплян или Ципанян, а здесь корень «цыпел» явно указывает на другое языковое гнездо.

Основа «цыпел» почти наверняка связана с диалектным словом «цыпел» или «ципел» — так в юго-западных говорах (украинских, белорусских, польских) называли куриного цыплёнка, а также неоперившегося птенца вообще. В польском языке есть слово «cypel» — мыс, выступ, но для фамилии прозвищного типа вероятнее уменьшительно-ласкательная форма от «цыпа» (курица). Прозвище Цыпель могли дать человеку маленького роста, худощавому или с высоким голосом, похожим на писк цыплёнка. Встречается и версия, что это форма от «цыпать» (мелко шагать, семенить), что тоже укладывается в образ суетливого или невысокого человека.

Географически фамилия Цыпелян привязана к бывшей Бессарабии и югу Молдавии. В метрических книгах XIX века носители фамилии фиксировались в Аккерманском, Измаильском и Хотинском уездах. Там, в зоне смешения молдавского, украинского и русского населения, фамилии на -ян нередко образовывались от прозвищ: молдаване добавляли суффикс -ян (как русские -ов) к чужой основе, и получалось что-то вроде «Цыпелян» — «сын Цыпеля» или «из рода Цыпелей». Сословно это были преимущественно крестьяне и мещане, реже — однодворцы.

Интересно, что в той же местности встречаются однокоренные фамилии Цыпель, Цыпляк, Цыпленко. Цыпелян стоит особняком благодаря своему окончанию, которое для русского уха звучит как армянское, но на деле — маркер бессарабского многообразия. Учитывая редкость фамилии, её носители, скорее всего, происходят из одной или двух родственных семей, разошедшихся по разным губерниям в конце XIX века.