Фамилия Цышек — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет ни одного из типичных русских фамильных суффиксов (‑ов, ‑ев, ‑ин, ‑ский), что сразу указывает на её позднее или нерусское происхождение. Скорее всего, перед нами полонизированная или украинизированная форма, где суффикс ‑ек встречается в фамилиях польского и западноукраинского ареала. В русской традиции такая модель нетипична — обычно фамилии на ‑ек (вроде Ковалёк, Паренёк) фиксировались как прозвищные и оставались редкими.

Основа «цыш‑» заставляет искать корни в диалектной или профессиональной лексике. Наиболее вероятная версия: от польского cichy или украинского тихий через чередование «ц» и «т» (ср. польск. cicho — тихо). В таком случае Цышек — это «тихоня», человек смирного нрава. В польских говорах встречается слово cyszek — уменьшительное от cichy, что даёт прямую параллель. Менее убедительна связь с немецким Zisch (шипеть, свистеть) или с цыганским цыша (маленький) — эти гипотезы не имеют документального подтверждения в ономастике.

Географически фамилия тяготеет к западным регионам бывшей Речи Посполитой: современная Польша, Западная Украина, Беларусь. В российских переписях XIX века Цышек не встречается — это косвенно подтверждает её позднюю миграцию в Россию, возможно, в XX веке. Если предки носили эту фамилию в Российской империи, они могли быть выходцами из Царства Польского или Волынской губернии.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает уточнить картину. Цышевский, Цышенко, Цышик — все они восходят к той же основе и распространены в тех же краях. Важно не путать Цышек с фамилией Цыганок (от «цыган») — корни разные, хотя внешнее сходство есть. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» этот тип не разбирается, что лишний раз подчёркивает его нерусское происхождение.

Таким образом, фамилия Цышек — скорее всего, польское или украинское прозвище, означавшее «тихоня» или «смирный человек». Она не имеет отношения к дворянским родам, не фиксируется в древних боярских списках и остаётся локальной, что делает её носителей потомками простых людей из западных земель.