Фамилия Цюпаченко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко. Этот суффикс, самый продуктивный в украинской ономастике, изначально имел значение «малый, сын того, кто назван в основе»: Цюпаченко — буквально «сын Цюпака» или «маленький Цюпак». Иными словами, фамилия образована от прозвища отца через патронимический суффикс.

Основа фамилии — «Цюпак» (или «Цюпака»). Само слово «цюпак» в украинских говорах имеет несколько значений, и выбор наиболее вероятного зависит от региона. Самая прямая версия связывает его с глаголом «цюпати» — рубить, тесать, делать мелкие удары (сравните с русским «тяпать»). В этом случае прозвище Цюпак мог получить дровосек, лесоруб или плотник, работающий топором. Вторая версия — от «цюпа» (или «цюпка»): так в некоторых диалектах называют небольшую палку, чурбан, а также низкорослого, коренастого человека. Тогда прозвище могло указывать на внешность или комплекцию.

География фамилии сосредоточена в центральных и восточных областях Украины, особенно в Черкасской, Полтавской и Киевской. Встречается она и на юге России, в Краснодарском крае и Ростовской области — в местах, куда активно переселялись украинские крестьяне в XVIII-XIX веках. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые в основном носили великорусские крестьяне, фамилии на -енко долгое время оставались маркером украинского происхождения, хотя со временем утратили эту жесткую привязку.

Интересно, что фамилия Цюпаченко стоит в ряду однокоренных: Цюпа, Цюпка, Цюпак, Цюпин, Цюпченко. Все они образованы от одной и той же звукоподражательной или описательной основы, что говорит о живом народном словообразовании, где одно и то же прозвище давало целое гнездо фамилий. Вариант с суффиксом -енко — самый молодой и «сыновний» в этом ряду, он закрепился за потомками человека, которого в округе знали как Цюпака.