Фамилия Цюцюркины — редкий случай, когда словообразовательная модель очевидна, а вот корень ставит в тупик даже специалистов. На первый взгляд перед нами типичная «вторичная» фамилия на -ин, образованная от прозвища или имени Цюцюрка. Суффикс -ин в русской ономастике указывает на принадлежность: «чей?» — «Цюцюркин», то есть сын или потомок Цюцюрки. Однако сама основа — Цюцюрк- — звучит нехарактерно для славянской фонетики. Сочетание «цю» в начале слова — редкость, и это сразу наводит на мысль о заимствовании или диалектном искажении.

Самая правдоподобная версия связывает фамилию с украинским или южнорусским диалектным словом «цюця» (или «цюцька») — так в некоторых говорах называют маленькую собачку, щенка, а в переносном смысле — избалованного, неженку или ласкового ребёнка. Уменьшительная форма Цюцюрка могла быть прозвищем человека небольшого роста, хрупкого телосложения или, наоборот, того, кого баловали и опекали. В пользу этой версии говорит и суффикс -юрк-, который характерен для украинских и белорусских уменьшительных форм (сравните: бабуся — бабюрка, мамуся — мамюрка). Таким образом, географически фамилия Цюцюркины, скорее всего, имеет западнорусские или малороссийские корни.

Вторая версия, менее вероятная, но не исключённая, — связь с древнерусским некалендарным именем Цюця или Цюца. Такие имена-прозвища, образованные от звукоподражаний (например, «цю-цю» — подзыв собаки), существовали в крестьянской среде. Однако документальных подтверждений бытования имени «Цюцюрка» в исторических источниках практически нет, что делает эту гипотезу умозрительной. Кроме того, попытки привязать фамилию к тюркским корням (например, к слову «чучук» — «маленький») разбиваются о фонетику: твёрдое «ч» в начале слова вряд ли перешло бы в мягкое «ц» без промежуточных диалектных форм, которых не сохранилось.

С точки зрения сословной принадлежности, фамилия Цюцюркины, вероятнее всего, крестьянская или мещанская. Формант -ин в сочетании с «говорящим» прозвищем из бытовой сферы указывает на среду, где прозвища были живыми и передавались по наследству без участия церковной или дворянской традиции. В современных телефонных справочниках и базах данных фамилия встречается крайне редко, в основном в центральных и южных областях России, что подтверждает её локальный характер.

Уникальность фамилии Цюцюркины ещё и в том, что она сохранила архаичную модель образования от прозвища, которое утратило свой первоначальный смысл. Сегодня носитель фамилии вряд ли ассоциирует себя со щенком или неженкой, но для этимолога это редкий пример того, как диалектное слово, почти исчезнувшее из речи, закрепилось в фамилии и дошло до наших дней.