Фамилия Тубашева — женская форма фамилии Тубашев. Её основа — прозвище или дохристианское имя Тубаш. Такие имена были распространены у тюркских народов, и фамилия, скорее всего, имеет тюркские корни. Слово «тубаш» в некоторых тюркских языках может означать «голова», «вершина», «вождь» или «предводитель». Соответственно, Тубашем могли прозвать уважаемого человека, старейшину или того, кто занимал руководящую должность в общине.

По другой, менее вероятной версии, в основе фамилии лежит гидроним — название реки Туба (приток Енисея). Тогда Тубашев — это выходец с берегов этой реки. Однако версия с прозвищем выглядит убедительнее, так как суффикс -аш характерен именно для тюркских личных имён и прозвищ (сравните: Карабаш, Акбаш, Яныбаш).

Фамилия Тубашев встречается в основном у народов Поволжья и Урала — у татар, башкир, чувашей. Это указывает на то, что предок носителя фамилии жил в зоне активного взаимодействия тюркских и финно-угорских племён. Русская фамилия образовалась по стандартной модели: к основе Тубаш добавили патронимический суффикс -ев (вариант -ов после мягкой согласной), что значит «сын Тубаша». Таким образом, Тубашева — это «принадлежащая роду Тубаша», потомка человека с именем-прозвищем, связанным с лидерством или высоким положением.