Фамилия Тухарян звучит как типичная армянская, и это первое, что приходит на ум. Действительно, суффикс -ян (или -янц) в армянской ономастике указывает на принадлежность к роду, происхождение от предка. В русской традиции фамилии на -ян обычно не склоняются и воспринимаются как иноязычные. Однако корень «тухар» заставляет задуматься: в армянском языке нет прямого общеупотребительного слова с таким значением, поэтому версия не лежит на поверхности.

Самая вероятная гипотеза связывает основу с названием древнего народа тохаров (или «тухаров» в русской транскрипции). Тохары — индоевропейские племена, жившие в Центральной Азии и оставившие след в истории Восточного Туркестана. Если фамилия восходит к этому этнониму, то её носители могли быть потомками людей, которых прозвали «тухар» за сходство с этим народом, за связь с ним по происхождению или за проживание в местах, где тохары оставили память. В армянской среде такие прозвища по этническому признаку — не редкость (ср. фамилии Врацян — «грузин», Парсиян — «перс»).

Менее распространённая, но возможная версия — от тюркского или иранского корня. В тюркских языках встречается слово «тухар» в значении «сборщик, собиратель» или как вариант имени (Тухар, Тухтар). В таком случае фамилия могла возникнуть у армян, живших в полиэтничной среде (например, в Закавказье или на Северном Кавказе), где тюркские и иранские заимствования проникали в быт. Суффикс -ян адаптировал это прозвище под армянскую модель.

Географически фамилия Тухарян встречается среди армянских диаспор России, Армении, Грузии, но не относится к числу массовых. Её редкость — дополнительный аргумент в пользу того, что она могла возникнуть не от широко распространённого имени, а от локального прозвища или редкого этнонима. В любом случае, перед нами фамилия, чей корень уходит в глубину веков — к контактам армян с древними народами Евразии.