Фамилия Туктакиев — одна из тех, что сразу выдают тюркские или монгольские корни. Её основа восходит к личному имени Туктак, которое в свою очередь образовано от тюркского слова «тукта» — «остановись», «стой». В прошлом такие имена-пожелания давали детям, чтобы защитить их от злых сил или остановить череду смертей в семье: считалось, что имя-оберег удержит жизнь ребёнка, не даст ей прерваться. По этой же модели возникли фамилии Туктаров, Тукташев, Туктагулов.

Суффикс -иев указывает на русскую адаптацию фамилии по патронимической модели. В языках Поволжья и Урала (татарском, башкирском) отчества образуются с помощью окончаний -ов, -ев, -ин, а форма на -иев встречается реже и чаще фиксируется в документах XIX — начала XX века, когда при переписи населения тюркские имена записывали на русский лад. Таким образом, Туктакиев — это буквально «сын Туктака» или «потомок Туктака».

География фамилии сосредоточена в Татарстане, Башкортостане и соседних регионах, особенно в Оренбургской области. Встречается она и среди казанских татар, и среди башкир, причём носители часто принадлежали к сословию государственных крестьян или тептярей — так называли переселенцев, плативших оброк, но не приписанных к помещикам. В метрических книгах и ревизских сказках XVIII–XIX веков фамилия могла писаться как Туктакеев или Туктакиев, что объясняется разницей в произношении диалектов: в одних говорах конечный «к» смягчали, в других — нет.

С точки зрения словообразования интересно, что имя Туктак не является усечением от сложного имени (как, например, Туктамыш — «остановившийся»), а стоит отдельно. В татарской ономастике такие короткие имена-обереги не редкость: вспомним фамилию Туктаров (от Туктар — «останови»). Туктакиев же сохранил редкую форму с удвоением корня, что делает его заметным на фоне более частых однокоренных вариантов.