Фамилия Тукубекова — тюркская по происхождению, и её разумнее всего рассматривать не через славянскую модель, а через составные части, характерные для казахской, киргизской и других тюркских антропонимических систем. Основа здесь — мужское имя Тукубек, которое, в свою очередь, складывается из двух компонентов.

Первая часть, «Туку», может восходить к древнетюркскому корню со значением «род», «племя» или «потомство». В таком случае Тукубек — это «бек (господин, князь) своего рода». Вторая версия, более прозаичная, связывает «Туку» с диалектным словом, означающим «сытый», «насыщенный» — то есть «бек, у которого всего вдоволь». В любом случае компонент «бек» (или «бий») чётко указывает на знатное или военное сословие: беками называли предводителей, старшин, влиятельных людей.

Фамилия образована по русской колониальной модели: к тюркскому имени добавили типичный русский суффикс принадлежности -ов и женское окончание -а. То есть Тукубекова — это «дочь (или жена) Тукубека». Мужской вариант — Тукубеков. Такая адаптация массово происходила в XIX — начале XX века, когда у кочевых народов начали фиксировать фамилии по отцовскому имени для учёта и налогообложения.

Географически фамилия чаще всего встречается в Казахстане и Киргизии, реже — среди татар и башкир. В России её носители живут преимущественно в Оренбургской, Астраханской областях и в Алтайском крае — регионах, где исторически были сильны тюркские общины.

С точки зрения социального статуса предки носительницы фамилии Тукубекова с высокой вероятностью были не рядовыми скотоводами, а относились к местной знати — аксакалам, биям или старшинам. Имя Тукубек давали не каждому, оно подчёркивало положение рода. Однако после советской унификации фамилий это значение стёрлось, и сейчас Тукубекова — просто одна из множества фамилий тюркского корня, указывающая на имя основателя семьи.