Фамилия Тупыгина — женская форма фамилии Тупыгин, и её разбор стоит начать с неочевидного: как именно звучало исходное прозвище. На слух корень «туп-» сразу наводит на мысль о «тупом» — несообразительном или грубом человеке. Однако в русских говорах, особенно северных и сибирских, слово «тупыга» или «тупырь» могло значить нечто совсем другое: так называли медлительного, упрямого человека либо, наоборот, того, кто «тупится» — то есть стоит на месте, не решается. Есть и более прозаичная версия: в некоторых диалектах «тупыга» — это короткий, тупой нож или инструмент, а прозвище могли дать мастеровому, работавшему плохим, затупленным орудием.

Суффикс «-ин» в основе указывает на притяжательное значение: Тупыгин — это «сын Тупыги» или «человек из рода Тупыги». Такая модель типична для прозвищ, оканчивающихся на -а/-я, и встречается в центральных и северных областях России. Если бы фамилия происходила от слова с окончанием на твёрдый согласный, мы бы увидели суффикс «-ов» (Тупов), но здесь именно «-ин» — верный признак того, что исходное прозвище звучало как Тупыга.

С географией фамилии всё скупо: Тупыгины встречаются в документах по Вологодской и Архангельской губерниям, а также в Зауралье — это согласуется с диалектным характером корня. В переписях XIX века носители фамилии числились преимущественно государственными крестьянами, то есть людьми, не знавшими крепостной зависимости. Никаких дворянских родов Тупыгиных не зафиксировано — фамилия осталась в крестьянской и мещанской среде.

Стоит упомянуть и редкую возможность: в некоторых старообрядческих общинах «тупыга» могло быть прозвищем за упрямство в вере — «тупой» в смысле «непреклонный». Но это лишь гипотеза, не подтверждённая прямыми источниками. В любом случае, фамилия Тупыгина — не про умственную ограниченность, а про бытовую характеристику характера или ремесла, закрепившуюся в северорусских говорах.